circRNA研究汇总 | 20200120-0126

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献共计37篇，下面我们一起来看看，circRNA研究最近有哪些新进展。

检索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR Circular RNA[Title/Abstract] 

1、综述：环状RNA的生物形成和功能的焦点问题。

标题：Biogenesis and Functions of Circular RNAs Come into Focus.

杂志：Trends In Cell Biology；

影响因子： 16.588

通讯作者：Jeremy E. Wilusz（宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院）

许多真核生物蛋白编码基因能够产生外显子来源环状RNA。这些环状RNA大多数低水平表达，但有些circRNA表达水平积累到比其相关的线性mRNA更高。这篇综述重点介绍了近年来开发的用于鉴定和表征这些circRNA转录本的几种方法，这些方法揭示了环状RNA如何产生和发挥作用的详细过程。现在很清楚，环状RNA水平的调节可导致多种分子和生理表型，包括对神经系统，先天免疫，microRNA和许多与疾病相关的途径的影响。

综述亮点提要：

环状RNA从许多真核生物蛋白质编码基因的pre-mRNA的“backspaces”剪切机制（下游5'剪接位点连接到上游3'剪接位点）中产生。

内含子重复元件之间的碱基配对通常促进了环状RNA的生物形成，而这些环状RNA表达又受RNA结合蛋白，核心剪接体成分的水平和外显子跳跃事件的的组合作用控制。

一旦产生，大多数环状RNA高度稳定，并以依赖于长度的方式从细胞核输出后，在细胞质中积累。

大多数环状RNA的生物学功能仍然未知，但是越来越明确的是，特定的环状RNA可以调节microRNA或RNA结合蛋白的活性，被翻译成蛋白质产物或调节先天免疫应答。

环状RNA在神经元组织中含量最高，随着年龄的增长而积累，并在包括癌症在内的人类疾病中发挥功能性作用。

图注：circRNA调控microRNA或翻译成多肽

2、全面鉴定人类组织转录组中的可变反向剪接事件。

标题：Comprehensive identification of alternative back-splicing in human tissue transcriptomes.

杂志：Nucleic Acids Research ；

影响因子：11.147

通讯作者：张鹏（上海市肺科医院胸外科）和 翁志萍（美国麻省大学医学院）

环状RNA（circRNA）是共价闭合的RNA，其来源于真核生物基因的反向剪接。通过可替代的反向剪接（ABS），单个基因可产生共享相同反向剪接位点的多个circRNA。尽管最近发现了许多ABS事件，但是ABS参与circRNA生物发生的程度以及如何在不同的人体组织中进行调节仍然是未知的。该研究中，作者报道了90个人类组织转录组中ABS事件，并进行了深入分析，研究结果发现大约84％的circRNA发生ABS。有趣的是，5'的可变反向剪接比3'的可变反向剪接更普遍，并且两者都是组织特异性的，尤其在脑组织表现高丰度。此外，在不同大脑区域中，ABS事件的模式彼此相似，并且比非脑组织中的模式更复杂。最后，内含子长度和Alu元件的丰度与ABS事件复杂性呈正相关，并且在同一ABS事件中，主要的circRNA具有比其他circRNA更长的侧翼内含子和更多的Alu元素。总之，该研究成果扩展了人们对人类组织转录组中circRNA的ABS事件的认识，并提供了对circRNA生物发生，表达和调控复杂性的见解。

图注：在人类组织转录组中普遍存在circRNA的ABS事件

3、circRNA在肿瘤微环境中的作用。

标题：Roles of circRNAs in the tumour microenvironment.

杂志：Mol Cancer ；

影响因子：10.679

通讯作者：刘金波、李晓丽和孙振强（郑州大学第一附属医院）

肿瘤微环境（TME）构成了肿瘤发展过程中的周围区域，并已证明通过与肿瘤细胞的串扰在癌症相关疾病中发挥作用。环状RNA（circRNA）是内源非编码RNA（ncRNA）的亚群，在真核生物中普遍表达，并且在调节癌症的发生和发展中具有多种生物学功能。越来越多的研究表明，circRNA参与TME的多方面生物学调控。但是，有关机制的细节至今仍难以捉摸。在这篇综述中，作者从各种角度分析了circRNAs对TME的影响，包括免疫监测，血管生成，缺氧，基质重塑，exo-circRNAs和放化疗抗性等。目前，circRNA在靶向治疗中以及作为无创性生物标志物的巨大潜力已引起广大科学家的关注。该篇综述着重强调了靶向TME相关的circRNAs的策略具有克服癌症耐药性和改善治疗效果的广阔前景。

图注：circRNA肿瘤微环境（TME）中的作用

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